Dans cet article, nous nous proposons d'examiner les fondements épistémologiques du modèle de phonologie diachronique élaboré par Martinet, en comparant son approche à celle du Cercle linguistique de Prague. Dans un premier temps, nous rappellerons les contacts que Martinet a entretenus avec différentes "écoles" structuralistes [1.]. Ensuite, nous examinons les traits essentiels de la conception pragoise du changement phonique (et linguistique en général) [2.]. Sous un troisième point, nous proposons une analyse du modèle fonctionnaliste de Martinet, centré autour du concept d'économie [3.]. Finalement, nous essayons de montrer que les différences qui opposent Martinet à Prague reposent sur un dilemme épistémologique fondamental, à savoir l'opposition entre le sujet parlant et le système linguistique [4.]